Molto antica è a Melfi la presenza dei francescani, con uno dei primi insediamenti al mondo. Infatti un frate minore di nome Sigismondo, quasi contemporaneo del fondatore, operò e morì a Melfi nel 1241 in piena epoca federiciana. L’attività dell’Ordine si distinse anche in campo culturale, con la fondazione di un prestigioso studio teologico. A Melfi nel corso dei secoli furono presenti i Conventuali, gli Osservanti, i Cappuccini e le Clarisse.